El CBPPR auspicia y fomenta organizaciones estudiantiles que cumplen dos propósitos fundamentales: (1) servir como medio para que el estudiantado exprese sus inquietudes y (2) desarrollar sus prioridades ministeriales proyectándose hacia el futuro. El trabajo de estas organizaciones está adscrito al Decanato de Servicios Estudiantiles. Estas organizaciones son:

1. Consejo de Estudiantes

2. Asociación Misionera

3. Asociación Pioneros por Cristo

4. Asociación Ministerial

5. Clase graduanda

6. Fraternidad de Estudiantes Internacionales

Cada organización estudiantil debe nombrar un miembro de la facultad a tiempo completo o parcial o del personal administrativo como su consejero(a). Este nombramiento debe ser consultado y aprobado por el (la) Decano(a) de Servicios Estudiantiles.